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新發現有望為CRISPR帶來基因編輯好幫手 相關研究已于今年6月刊發于預印本平臺bioRxiv

2020-11-13 14:39:55來源:《中國科學報》  

2020年諾貝爾化學獎頒給了基因編輯工具CRISPR,如今,研究者又有新發現,有望與CRISPR結合,發揮更好的功用。

11月初,來自以色列魏茨曼科學研究所的Rotem Sorek團隊在《細胞》上刊發文章,介紹了他們新發現的基于逆轉錄酶基因編輯工具——Retrons。與CRISPR類似,該工具可保護微生物免受噬菌體病毒侵害,研究者有望利用它對單細胞生物的基因進行編輯。

早在30多年前,就有科學家從黃色黏球菌中發現了逆轉錄酶,這一遺傳元件由DNA、RNA和來自某些細菌中的蛋白質復合而成,但一直以來它們在生物體中的作用不甚明確。

據《科學》報道,在最新發表的研究里,Sorek等人在許多細菌中都發現了逆轉錄酶。他們先搜索了近4萬個細菌的基因組,并利用計算機程序尋找與CRISPR和其他已知抗病毒構建體基因相近的抗病毒結構。

之后,研究者找到了一段包含逆轉錄酶的DNA,該元件側翼是無法編碼任何已知細菌蛋白的DNA片段。研究者聯想到這些神秘的序列可能在RNA編碼中發揮作用。此外,帶逆轉錄性質的DNA通常伴隨著一個蛋白質編碼基因,每個遺傳元件攜帶的蛋白質有所不同。

Sorek等人猜測,這些序列簇參與到一種新的噬菌體防御中。后續研究中,他們進一步證明,包含了逆轉錄酶、DNA和RNA混合物以及蛋白質的元件Ec48可破壞新感染的細胞,從而使病毒無法復制和傳播。

無獨有偶,歐洲分子生物學實驗室也有一個研究團隊有類似發現,他們在沙門氏菌中逆轉錄的編碼基因旁邊發現了有毒的蛋白質基因,通常情況下毒素會被包裹起來,當噬菌體蛋白出現時則被激活。相關研究已于今年6月刊發于預印本平臺bioRxiv。

研究者可利用CRISPR靶向并切割基因組中的目標區域,但迄今為止,該工具還不太擅長在靶點DNA中引入新代碼,若CRISPR能與此次發現的Retrons相結合,或許能產生所需序列的多重拷貝,并有效剪接到宿主基因中。不過目前,Retrons還未被證實可在哺乳動物細胞中工作,還有許多工作有待完成。(袁柳)

責任編輯:hnmd003

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